Ubuntu+python將nii圖像保存成png格式
更新時間：2019年07月18日 15:00:54 作者：無寵不驚過一生
這篇文章主要介紹了Ubuntu+python將nii圖像保存成png格式，文中通過示例代碼介紹的非常詳細(xì)，對大家的學(xué)習(xí)或者工作具有一定的參考學(xué)習(xí)價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)吧
這里介紹一個nii文件保存為png格式的方法。
這篇文章是介紹多個nii文件保存為png格式的方法：
http://www.fzitv.net/article/165692.htm
系統(tǒng)：Ubuntu 16.04
軟件： python 3.5
先用pip安裝nibabel、numpy、imageio、os。
import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
def read_niifile(niifile): #讀取niifile文件
img = nib.load(niifile) #下載niifile文件（其實是提取文件）
img_fdata = img.get_fdata() #獲取niifile數(shù)據(jù)
return img_fdata
def save_fig(file): #保存為圖片
fdata = read_niifile(file) #調(diào)用上面的函數(shù)，獲得數(shù)據(jù)
(x,y,z) = fdata.shape #獲得數(shù)據(jù)shape信息：（長，寬，維度-切片數(shù)量）
for k in range(z):
silce = fdata[k,:,:] #三個位置表示三個不同角度的切片
imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
#將切片信息保存為png格式
dir = './.nii' #nii的路徑
savepicdir = '' #保存png的路徑
os.mkdir(savepicdir) #創(chuàng)建文件夾
save_fig(dir) #運行程序，保存為圖像
不要忘記返回img_fdata，否則下一個文件會報錯。
以上就是本文的全部內(nèi)容，希望對大家的學(xué)習(xí)有所幫助，也希望大家多多支持腳本之家。
相關(guān)文章
今天小編就為大家分享一篇python繪制雙Y軸折線圖以及單Y軸雙變量柱狀圖的實例，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2019-07-07
這篇文章主要介紹了如何寫好?Python?的?Lambda?函數(shù),Lambda?函數(shù)是?Python?中的匿名函數(shù),下面文章通過介紹Lambda?函數(shù)的相關(guān)內(nèi)容展開文章主題，需要的小伙伴可以參考一下2022-03-03
python?DataFrame數(shù)據(jù)分組統(tǒng)計groupby()函數(shù)的使用
在python的DataFrame中對數(shù)據(jù)進(jìn)行分組統(tǒng)計主要使用groupby()函數(shù)，本文主要介紹了python?DataFrame數(shù)據(jù)分組統(tǒng)計groupby()函數(shù)的使用，具有一定的參考價值，感興趣的可以了解一下2022-03-03
本文介紹了如何在Python中生成一到一百隨機整數(shù)的多種方法,包括random庫,NumPy庫和random.sample函數(shù)這三種方法,具有一定的參考價值,感興趣的可以了解一下2024-02-02
PyCharm上安裝Package的實現(xiàn)(以pandas為例)
這篇文章主要介紹了PyCharm上安裝Package的實現(xiàn)(以pandas為例)，文中通過示例代碼介紹的非常詳細(xì)，對大家的學(xué)習(xí)或者工作具有一定的參考學(xué)習(xí)價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)吧2020-09-09
這篇文章主要介紹了django2筆記之路由path語法的實現(xiàn)，文中通過示例代碼介紹的非常詳細(xì)，對大家的學(xué)習(xí)或者工作具有一定的參考學(xué)習(xí)價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)吧2019-07-07
這篇文章主要介紹了python 讀取.nii格式圖像實例，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。一起跟隨小編過來看看吧2020-07-07
Python批量將Word文件轉(zhuǎn)為PDF文件的實現(xiàn)示例
如果想要批量把Word文檔轉(zhuǎn)換為PDF文檔,我們可以使用第三方模塊win32com,本文就來詳細(xì)的介紹一下Python批量將Word文件轉(zhuǎn)為PDF文件的實現(xiàn)示例,感興趣的可以了解一下2023-08-08
詳解pytorch tensor和ndarray轉(zhuǎn)換相關(guān)總結(jié)
這篇文章主要介紹了詳解pytorch tensor和ndarray轉(zhuǎn)換相關(guān)總結(jié)，文中通過示例代碼介紹的非常詳細(xì)，對大家的學(xué)習(xí)或者工作具有一定的參考學(xué)習(xí)價值，需要的朋友們下面隨著小編來一起學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)吧2020-09-09
這篇文章主要介紹了python中的三種注釋方法，具有很好的參考價值，希望對大家有所幫助。如有錯誤或未考慮完全的地方，望不吝賜教2022-06-06