Schrodinger PyMOL是一款功能強(qiáng)大的分子查看器和渲染器。 它可用于準(zhǔn)備出版質(zhì)量的圖形、與同事共享交互式結(jié)果或生成預(yù)渲染動(dòng)畫。 如今，全世界成千上萬(wàn)的科學(xué)家經(jīng)常依賴 PyMOL 來(lái)完成此類任務(wù)。

PyMOL破解版主要是圖形、電影和演示文稿生成工具。 然而，它也可以用于各種常規(guī)和專業(yè)任務(wù)，例如靜電表面電位和分子動(dòng)力學(xué)軌跡的可視化。

在圖形制作方面，PyMOL 是 Molscript、BobScript、PovScript 和 Raster3D 的替代品。 PyMOL 相對(duì)于這些包的主要優(yōu)勢(shì)是能夠使用圖形用戶界面代替（或除此之外）命令行腳本。

關(guān)于電影生成，PyMOL 可以創(chuàng)建和輸出 3D 分子電影，其方式與這些其他工具對(duì)一般 3D 動(dòng)畫 Maya、Blender、Cinema4D 和 3ds Max 所做的大致相同。 PyMOL 還可用于生成幾何輸入，以與這些通用動(dòng)畫工具一起使用。

關(guān)于演示文稿，PyMOL 的工作方式類似于動(dòng)畫 3D 分子 PowerPoint，因?yàn)?PyMOL 會(huì)話（類似于 PowerPoint PPT 文件）可以使用一系列場(chǎng)景（類似于 PowerPoint 幻燈片）構(gòu)建，這些場(chǎng)景從一個(gè)平滑地流動(dòng)到另一個(gè)以傳達(dá)結(jié)果或告訴故事。

安裝激活教程

1、在本站下載并解壓，如圖所示

2、安裝程序，勾選agree

3、選擇all users選項(xiàng)

4、安裝完成，將破解的文件復(fù)制到安裝目錄中，替換

5、運(yùn)行程序，點(diǎn)擊browse選擇剛才復(fù)制過(guò)去的lic許可證文件

新功能

2.5.4新功能

1、獨(dú)家激勵(lì) PyMOL 功能

所有 PyMOL 操作的多級(jí)撤消/重做

MAE 導(dǎo)入：更多功能區(qū)樣式和標(biāo)簽改進(jìn)

MAE 導(dǎo)入對(duì)話框：離散狀態(tài)支持

構(gòu)建器：來(lái)自PDB的核苷酸現(xiàn)在可以擴(kuò)展

APBS 插件：PDB2PQR 3 兼容性

STL 導(dǎo)出：導(dǎo)出時(shí)的平均法線

“sphere_mode”的 10/11 縮放

生成器：“清除殘留物”按鈕添加

加載 collada 作為 CGO

2、文件導(dǎo)入/導(dǎo)出

DX 二進(jìn)制映射導(dǎo)入支持 （*dxbin）

PDB/MMTF 導(dǎo)出：現(xiàn)在添加了對(duì)稱信息

改進(jìn)的 FASTA 導(dǎo)入

支持地圖.gz和 mrc.gz 擴(kuò)展

3、建筑商和面板

生成器：改進(jìn)的保險(xiǎn)絲命令（不允許超價(jià)鍵，替換一價(jià)原子而不是附著在它們上）

面板：可自定義的鍵盤快捷菜單

面板：屬性檢查器現(xiàn)在支持使用“刪除”鍵取消設(shè)置設(shè)置

4、圖形與可視化

光線內(nèi)部顏色現(xiàn)在與“設(shè)置ray_interior_color，原子”匹配基元 120

等值網(wǎng)格透明度支持

“sphere_mode”刪除了 5（9 作為替換）

彎曲的卡通圓柱形螺旋“cartoon_cylindrical_helices=1”（前一個(gè)=2）。#131

通過(guò)設(shè)置“isosurface_algorithm， （0， 1）”的行進(jìn)立方體生成等值面（0 需要 VTKm）

5、中國(guó)人民銀行處理

在重新粘合、平滑和intra_fit中支持的周期性邊界條件

6、接口更改

刪除了對(duì) Python 2 的支持

添加了 PBC 參數(shù)以重新綁定、平滑和intra_fit

png（無(wú)） 返回字節(jié)

scene_order（） 允許“名稱”列表

添加了pbc_wrap（） 和pbc_unwrap

matrix_reset（） 支持所有狀態(tài)的“state=0”

editing_ring（） 已添加

取消設(shè)置現(xiàn)在恢復(fù)全局設(shè)置的默認(rèn)值

load_traj現(xiàn)在默認(rèn)使用 state=1

get_area命令和點(diǎn)表示形式：排除“標(biāo)志忽略”原子

功能特色

1、圖形質(zhì)量

內(nèi)置的光線追蹤器可為您提供任何場(chǎng)景的陰影和深度。您也可以在外部渲染。

2、電影

創(chuàng)建電影就像加載多個(gè)PDB文件并點(diǎn)擊播放一樣簡(jiǎn)單。

3、輸出選項(xiàng)

圖像可以直接復(fù)制和粘貼到PowerPoint和Keynote中。靜態(tài)圖像和渲染序列可以PNG格式輸出，也可以輸出為QuickTime電影（在Mac OS X上）。

4、原子選擇

任意邏輯表達(dá)式有助于集中可視化和編輯。

5、表面再現(xiàn)

與Grasp一樣好，甚至更好，并且也支持網(wǎng)格表面。

6、卡通再現(xiàn)

PyMOL的卡通幾乎與Molscript一樣漂亮，但更容易創(chuàng)建和渲染。

7、命令行和GUI控制

復(fù)雜的“現(xiàn)實(shí)世界”應(yīng)用程序通常需要兩者。

8、Molecular Splits/Joins

結(jié)構(gòu)可以在運(yùn)行中被切片、突變和重組，并寫入標(biāo)準(zhǔn)文件（即PDB、MOL/SDF）。

9、腳本

控制PyMOL的最佳方法之一是通過(guò)可重用的腳本，這些腳本可以用命令語(yǔ)言或Python編寫。

10、構(gòu)象編輯

點(diǎn)擊和拖動(dòng)界面允許您自然地編輯構(gòu)象。雕刻允許分子適應(yīng)您的變化。

11、可擴(kuò)展性

PyMOL Python API提供了一種可靠的擴(kuò)展和接口方式。

12、跨平臺(tái)代碼

單一代碼庫(kù)支持Unix、Macintosh和Windows，使用OpenGL和Python以及一小組開源外部依賴項(xiàng)。